Hallo Katzenmama,
mit dem Tierarztgeruch hat das wenig zu tun.
Gerade unter Wohnungskatzen herrscht häufig eine gewisse Spannung und wirklich lieben tun sich die wenigsten erwachsenen Kätzinnen.
Wird nun eines der beiden Tiere aus der Wohnung gebracht, ist die zurückbleibende Katze froh, dass sie die „blöde Kuh“ jetzt endlich los ist.
Kaum hat sie sich auf ein Leben als „Kronprinzessin“ eingestellt, kommt die Konkurrentin aber wieder zurück. Diese wird dann mal gleich ordentlich verprügelt, in der Hoffnung, sie schnell wieder aus dem Haus zu treiben.
Ich würde beide Katzen mit Transportkäfigen ins Auto packen und mit ihnen eine wirklich wüste Autofahrt mit reichlich Kurven, Kopfsteinpflaster und lautem Hard Rock unternehmen und sie danach gemeinsam im gleichen Zimmer wieder raus lassen. In den meisten Fällen haben die Streithähne dann erst mal keine Lust mehr, sich zu zanken.
Katastrophen verbrüdern 
In Zukunft würde ich immer beide Katzen zum Tierarzt oder sonst wohin mitnehmen und gleichzeitig wieder in der Wohnung freilassen.
Gruß
Johnny
P.S.: Du solltest die Katzen so schnell wie möglich wieder zusammenführen. Je länger die Trennung desto schwieriger die „Versöhnung“.