Die Erklärung für 2019, gehe ich mal von aus.
Abzüglich der für 2019 geleisteten Vorauszahlungen.
Vermutlich hast du am 10.03.2020 1000 € für 2020 vorausgezahlt und am 10.06.2020 noch einmal 1000 € für 2020 vorausgezahlt. Diese Vorauszahlungen für 2020 werden nicht mit deiner Nachzahlung für 2019 verrechnet.
Die Steuerschuld für 2019 wird dann getilgt sein, nicht die für 2020.