Hallo,
immer wieder die Leute ohne Ahnung, die am PC rummurksen. 
Also: die Jumper sind dafür da, dem PC bzw. Bios mitzuteilen, welches die erste, zweite, dritte oder vierte Festplatte ist (bzw. CD/DVD-Laufwerk). Um es noch komplizierter zu machen nennt man das dann primary Master, sekundary Master, primary Slave und secondery Slave.
Das System bootet normalerweise vom primary Master, das ist Laufwerk c:. Wenn jetzt zwei Festplatten als primary Master gejumpert sind, dann weiss das Bios nicht, von welcher Platte es das Betriebssystem laden soll, und macht meist gar nichts. Evtl. wird - wie bei Dir - die Festplatte auch nicht erkannt.
Auf jeder Festplatte steht drauf, wie sie gejumpert werden kann. Also: alle Laufwerke ausbauen (Festplatten und CD/DVD-Laufwerke). Die Festplatte, die als c:/ laufen soll, anklemmen. Starten und sehen, ob sie in der Startup-Sequenz als primary Master angezeigt wird. Wenn nicht, ausschalten, umjumpern (nicht während des Betriebes) und neu starten. So lange, bis es stimmt.
Dann das gleiche Spiel mit der zweiten Festplatte. Die muss allerdings als secondary Master gejumpert werden.
Und dann weiter mit dem CD-Laufwerk (primary Slave).
Ich würde viel Zeit einplanen !
Hausaufgabe: übersetze die Begriffe jumpern, primary Master, secondary Master, primary Slave und secondary Slave in verständliches Deutsch. Grins.
Gruss
Andreas