Hallo,
ich bin auf der Suche nach einem möglichst spezifischen und sensitiven Fluoreszenzfarbstoff für dsRNA.
Die Dyes, die ich so gefunden habe (SYBR Green II, SYBR Gold u.ä) scheren sich laut Produktbeschreibungen nicht darum, DNA, RNA und v.a. ssRNA und dsRNA zu unterscheiden.
Ich habe nicht herausfinden können, ob SYBR Green II eigenlich auch doppelsträngigen RNA-Abschnitte benötigt (so ähnlich wie SYBR Green I mit der DNA), ob es also bei wirklich *nur* als ssRNA (also ohne stem-Strukturen u.ä.) vorliegender RNA überhaupt ein nennenswertes Signal gibt.
Hat jemad Erfahrungen mit den Farbstoffen? -> wie gut diskriminieren die DNA von RNA?
Kennt jemand „bessere“ Farbstoffe?
Danke schonmal & LG
Jochen