Hallo,
aufgrund dieser vielen Fragen ist es dringend geboten, dass Du bei Deiner örtlichen IHK, Sparkasse oder Wirtschaftsförderungsgesellschaft ein Existenzgründerseminar mitmachst!
- Wo meld ich mich als kleinunternehmer an?
Du meldest Dich als Unternehmer bei der Gewerbeabteilung Deiner Stadt/Kommune an.
- Wie überprfüft das Finanzamt ob ich wirklich
kleinunternehmer bin und den Staat nicht bescheißen will?
Durch Betriebsprüfungen und Querprüfungen, ob Deine eingereichte Angaben stimmig sind.
3)Muss ich Buchführung führen?
Als Kleinunternehmer reicht auch eine Einnahme-/Überschussrechnung.
4)Wenn ich bei ebay einen shop eröffnen will, muss ich dann
schreiben das ich Gewerblich bin?
Das kannst Du bei eBay genau durchlesen und es wird dort auch explizit bei der Anmeldung nachgefragt.
5)Muss ich Gewährleistung geben und Rückgaberecht? und wer
trägt dann die Versandkosten, ich oder der den Artikel gekauft
hat?
Kommt immer auf Dein Produkt an. Im Prinzip aber ja. Versandkosten ist Verhandlungssache, allerdings gibt es Sonderregeln für Rücksendungen.
6)Muss ich eine Rechnung schreiben, oder kann ich es lassen?
da ich ja sowieso die Mwst nicht angeben darf?
Natürlich kannst Du es lassen, eine Rechnung zu schreiben. Allerdings muss dann Dein Kunde auch nicht zahlen 
Die Mwst. MUSST Du allerdings angeben! Und wenn Du ohne Mwst. handelst, musst Du angeben, dass die Leistung ohne Mwst. aufgrund Kleinstunternehmerregelung erbracht wird.
Bei weiteren Fragen suche bitte entsprechende Foren und Seiten auf und les Dich dort schlau.
Viel Erfolg!
Frdl. Gruss
Marian