Hatte ich mal probiert, das hat aber nichts gebracht
mit „Profilordner“ meinte ich den von Firefox, siehe meine erste Antwort unter „Hintergrundinformationen“. Da steht auch, wie Du zB die Bookmarks von gestern findest…
Vielleicht hilft das.
Da Du sogar schon ein neues Profil probiert hast, weiss ich grad leider auch nichts mehr - nur teste auch jeden Fall nochmal Deinen Virenscanner. Vielleicht machst Du Bookmarks zu Seiten, die Dein Scanner als gefährlich einstuft und deshalb löscht er dann die ganze bookmarks.html.
Falls das nichts bringt und sich hier keiner mehr meldet, könntest Du auch mal im deutschen Firefox-Forum die Suche benutzen oder danach auch dort mal posten, vielleicht hilfts: http://www.firefox-browser.de/forum/