Hallo!
Erst einmal: Es läuft immer ein wenig Wasser in die Türen.
Deshalb auch die Folie, die zwischen Blech und Türpappen veklebt wurde und die kleinen Löcher unten in den Türen, damit das Wasser schnell wieder nach außen ablaufen kann.
Durch den grösseren Spalt kann aber auch Dauer - echt längere Zeit - mehr Staub und Dreck in die Tür wandern, sich unten als Schlamm absetzen und diese Löcher verstopfen. Dann bleibt Wasser in der Tür stehen, das führt dann evtl. zu stärkeren Rostbefall oder das Wasser sucht sich einen anderen Weg evtl. sogar in den Fahrgastraum.
Zu Deiner Frage:
Kurzfristig sollte der leicht stärkere Wasserduchfluss keine Probleme bereiten, aber langfristig solltest Du die Fenstergummis erneuern, damit es nicht zu unerwarteten Problemen mit Rost oder Wassereinbruch in den Innenraum kommen kann.
MfG
Adam