Ich brauche (relativ dringend) Informationen, mit welchen
Programmen man TIF-Bildstapel bearbeiten kann. Zur Erklärung:
Bilder eine Konfokalmikroskops, 2-3 verschiedene Stapel, je etwa
30-50 Einzelbilder, die in Z-Richtung durch ein Präparat gehen.
Das dem Mikroskop beiligende PÜrogramm ist anno-tobac und bietet
ausser dem Export als Einzelbild keine weiteren Optionen - was
mir etwas zu wenig ist. Hier vorhanden ist Photoshop 7, kA ob
man damit etwas ausrichten kann, ich habe jedenfalls noch nicht
gefunden. Ich suche ein Programm, mit dem ich diese Stapel z.B:
auch nur partiell zum Einzelbild zusammenziehen kann etc.
Hallo!
Sollte mit Photoshop doch funktionieren. Aktion: neue Aktion,dann eine Bilddatei wie gewünscht ausführen,dann Ende der Aktion (oder so).Man kann der Aktion eine Taste zuweisen.Dann Datei,Stapelverarbeitung und den Ordner angeben. Und ab geht die Post. In der Hilfe auch gut beschrieben.
Beste Grüße aus dem grauen und kalten Bremen
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Hallo!
Sollte mit Photoshop doch funktionieren. Aktion: neue
Aktion,dann eine Bilddatei wie gewünscht ausführen,dann Ende
der Aktion (oder so).Man kann der Aktion eine Taste
zuweisen.Dann Datei,Stapelverarbeitung und den Ordner angeben.
Und ab geht die Post. In der Hilfe auch gut beschrieben.
Beste Grüße aus dem grauen und kalten Bremen
nur partiell zum Einzelbild zusammenziehen kann etc.
kleine Begriffverwirrung - mea culpa !
Ich will keinen Stapel aus Dateien bearbeiten, das demMikroskop
beiliegende Programm speichert die Dinger als eine Datei(8 bit,
1024x1024 wird ddabei etwa 100 MB gross), dabei mehrere Kanäle
pro Frame. Jedes Frame stellt sozusagen eine Schnittebene dar,
die Kanäle muessen Frameweise übereinandergelegt werden und dann
die Bilder sozusagen von unten nach oben als Layers angeordnet
werden. Kann die mitgelieferte Software, aber: ich habe ein paar
Aufnahmen hier, die sozusagen von oben nach unten aufgenommen
wurden, also in der falschen Reihenfolge. Das Präparat dazu
existiert nicht mehr, also kein neu aufnehmen. Wenn ich die
Tif-Datei in Photoshop öffne, zeigt er nur Frame 1, Kanal 1.
Als Import (z.B. in der Automatisierung) kann er das auch nicht.
Hallo Ewald,
mir fiele dazu auch nur Photoshop ein. Um dort die entsprechenden Ebenen (mit den jeweils zugehörigen Kanälen) zu erhalten, klappts vielleicht so (?):
Aus Deinem (beiliegendem) Programm jeden Frame kopieren und in Photoshop einfügen --> es wird automatisch eine neue Ebene angelegt, die man in der Reihenfolge verschieben, umbenennen oder sonstwie bearbeiten kann. Dabei bleiben auch die (RGB-)Kanäle erhalten - es werden von Deinem Programm wahrscheinlich nur RGB-Daten geliefert. Wenn nicht, kannst Du diese Daten notfalls nach der Übernahme in Photoshop über das Menü Bild/Modus in den gewünschten Modus übernehmen.
Speichern dann als Photoshop-Datei (*.psd), dann bleiben ALLE Daten erhalten.
Hoffentlich hilfts.
Gruß Stefan
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Hallo Ewald,
mir fiele dazu auch nur Photoshop ein. Um dort die
entsprechenden Ebenen (mit den jeweils zugehörigen Kanälen) zu
erhalten, klappts vielleicht so (?):
Aus Deinem (beiliegendem) Programm jeden Frame kopieren und in
Photoshop einfügen --> es wird automatisch eine neue Ebene
angelegt, die man in der Reihenfolge verschieben, umbenennen
oder sonstwie bearbeiten kann. Dabei bleiben auch die
(RGB-)Kanäle erhalten - es werden von Deinem Programm
wahrscheinlich nur RGB-Daten geliefert. Wenn nicht, kannst Du
diese Daten notfalls nach der Übernahme in Photoshop über das
Menü Bild/Modus in den gewünschten Modus übernehmen.
Speichern dann als Photoshop-Datei (*.psd), dann bleiben ALLE
Daten erhalten.
Gute Idee - allerdings ist der Rechner am Mikroskop ein
Windows-Rechner, der vom Mikroskop-Hersteller stammt … und
Photoshop läuft auf dem Mac daneben
Allerdings hat sich ein Kollege mittlerweile erinnert irgendwann
ein Tool gehabt zu haben, das die TIF-Bilder in Einzeldateien
schreibt und umgekehrt - die kann ich dann ja per PS
automatisiert bearbeiten. Der Kollege muss das Tool nur noch
finden - wünscht mir Glück !
