Zytogenetik von A549-Zellen

Wissenschaft Biologie
1

Hallo,

ich würde A549-Zellen gerne für die Prüfung einer Methode verwenden, welche Gen-Amplifikationen und -Deletionen nachweisen können soll. Als immortale Zelllinie haben die A549-Zellen viele derartige Veränderungen im Genom erfahren, das steht ja auch in der Beschreibung bei ATCC:

This is a hypotriploid human cell line with the modal chromosome number of 12, occurring in 24% of cells. Cells with 64 (22%), 65, and 67 chromosome counts also occurred at relatively high frequencies; the rate with higher ploidies was low at 0.4%. There were 6 markers present in single copies in all cells. They include der(6)t(1;6) (q11;q27); ?del(6) (p23); del(11) (q21), del(2) (q11), M4 and M5. Most cells had two X and two Y chromosomes. However, one or both Y chromosomes were lost in 40% of 50 cells analyzed. Chromosomes N2 and N6 had single copies per cell; and N12 and N17 usually had 4 copies.

Leider bin ich kein Experte in Zytogenetik und verstehe ich die Hälfte nicht:

  • was zB. heißt der(6)t(1;6) (q11;q27)?
  • ist mit N2 das Chromosom Nr. 2 gemeint?
  • Was ist mit M4 und M5 gemeint?

Dann bin ich mir unsicher:

  • Kann man davon ausgehen, dass (nahezu) jede Zelle genau 2 X-Chromosomen enthält?

Und schließlich:

Hat jemand Informationen über die Amplifikationen/Deletionen definierter Gene?

Bin dankbar für jede Hilfe,

Jochen

2

Hallo Jochen: Als Laie mit Halbwissen übermittle ich Dir per E-Mail einige Kopien von Seiten aus „Taschenlehrbuch Humangenetik, Jan Murken/…, 7.Auflage, 2006, 598 Seiten, Thieme Verlag“. Auf den Kopien sind die Regeln beschrieben nach denen Gen-Modifikationen, Deletionen etc. kodifiziert werden. Es freut mich dem sonst alles wissenden Jochen Literaturkenntnisse zu vermitteln. Viel Spass und Gruss. Paul

Hallo,

This is a hypotriploid human cell line with the modal
chromosome number of 12, occurring in 24% of cells. Cells with
64 (22%), 65, and 67 chromosome counts also occurred at
relatively high frequencies; the rate with higher ploidies was
low at 0.4%. There were 6 markers present in single copies in
all cells. They include der(6)t(1;6) (q11;q27); ?del(6) (p23);
del(11) (q21), del(2) (q11), M4 and M5. Most cells had two X
and two Y chromosomes. However, one or both Y chromosomes were
lost in 40% of 50 cells analyzed. Chromosomes N2 and N6 had
single copies per cell; and N12 and N17 usually had 4 copies.
Leider bin ich kein Experte in Zytogenetik und verstehe ich
die Hälfte nicht:

  • was zB. heißt der(6)t(1;6) (q11;q27)?
  • ist mit N2 das Chromosom Nr. 2 gemeint?
  • Was ist mit M4 und M5 gemeint?
    Bin dankbar für jede Hilfe,
    Jochen